Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2OQ9C0C9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms