Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
NLRP1Q9C000 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms