Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CELF4Q9BZC1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF4Q9BZC1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms