Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PCGF6Q9BYE7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PCGF6Q9BYE7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PCGF6Q9BYE7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PCGF6Q9BYE7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PCGF6Q9BYE7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PCGF6Q9BYE7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PCGF6Q9BYE7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PCGF6Q9BYE7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PCGF6Q9BYE7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PCGF6Q9BYE7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PCGF6Q9BYE7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PCGF6Q9BYE7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PCGF6Q9BYE7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PCGF6Q9BYE7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PCGF6Q9BYE7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PCGF6Q9BYE7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PCGF6Q9BYE7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PCGF6Q9BYE7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PCGF6Q9BYE7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms