Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK3Q9BYB0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SHANK3Q9BYB0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK3Q9BYB0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK3Q9BYB0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK3Q9BYB0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK3Q9BYB0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK3Q9BYB0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK3Q9BYB0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK3Q9BYB0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK3Q9BYB0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHANK3Q9BYB0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHANK3Q9BYB0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SHANK3Q9BYB0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHANK3Q9BYB0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHANK3Q9BYB0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHANK3Q9BYB0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHANK3Q9BYB0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms