Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1QTNF3Q9BXJ4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms