Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
SYCP2Q9BX26 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms