Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms