Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms