Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP58Q9BVL2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP58Q9BVL2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms