Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf16Q9BUW7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf16Q9BUW7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms