Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms