Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAGR1Q9BTK6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms