Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms