Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF8Q9BRL6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms