Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms