Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM7Q9BQ49 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM7Q9BQ49 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM7Q9BQ49 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM7Q9BQ49 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM7Q9BQ49 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM7Q9BQ49 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM7Q9BQ49 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM7Q9BQ49 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM7Q9BQ49 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM7Q9BQ49 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM7Q9BQ49 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM7Q9BQ49 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM7Q9BQ49 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms