Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms