Protein–RNA interactions for Protein: Q99767

APBA2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA2Q99767 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APBA2Q99767 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APBA2Q99767 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms