Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SMAD5Q99717 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD5Q99717 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD5Q99717 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms