Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms