Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHP1Q99653 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms