Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3CQ99613 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms