Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
MYCBPQ99417 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYCBPQ99417 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms