Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms