Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
UHRF1Q96T88 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms