Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRBNQ96SW2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms