Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms