Protein–RNA interactions for Protein: Q96QA5

GSDMA, Gasdermin-A, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMAQ96QA5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GSDMAQ96QA5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSDMAQ96QA5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms