Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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