Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PGLYRP2Q96PD5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms