Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms