Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE3Q96MG7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms