Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms