Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC7Q96M83 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms