Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FAM227BQ96M60 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM227BQ96M60 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms