Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNPC3Q96LT9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNPC3Q96LT9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms