Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms