Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms