Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms