Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCC12Q96J65 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms