Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms