Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms