Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms