Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms