Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NMD3Q96D46 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms