Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TM4SF18Q96CE8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF18Q96CE8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms