Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX58Q96C10 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX58Q96C10 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms