Protein–RNA interactions for Protein: Q96BH1

RNF25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF25Q96BH1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF25Q96BH1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF25Q96BH1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms