Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TSR2Q969E8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSR2Q969E8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms